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rna浓度太低可以做cdna吗 |
cdna浓度多少合适,影响cDNA浓度的因素
不同品牌的反转录产物的cDNA浓度差异很大,但定量实验中的Ct值几乎相同。 反转录系统中dNTP输入量的不同会导致cDNA浓度的测定结果存在较大差异,但最终的Ct值几乎相同。 表1.纳米滴定量结果统计表。对于长片段PCR,建议将反应体系中的cDNA浓度稀释至1:10(或1:100-1:200)6.在没有逆转录酶的情况下,对照RNA扩增结果通常是由对照RNA中含有微量DNA引起的。 由于体外移植
这样得到的cDNA浓度应为100ng/ul。然后实时进行,多少cDNA合适? 人们通常如何稀释它? 这个很难说,一般都是稀释10倍,1微升做模板。不过我做了1-100ng/ul(工作浓度)的低拷贝基因。 浓度过低和过高都会影响放大效率,但不是绝对的。 因为有的基因表达量极低,有的基因在特殊情况下表达量极高。 qPCR通常只反映安全性
例如:如果要扩增某个处理组的GAPDH内参基因,则对反转得到的cDNA进行10倍梯度稀释。得到的cDNA浓度梯度为:100(原液)、10-1、10-2、10-3、10-4,我们在qPC上同时计算4个cDNA模板。例如,1OD260/280=33ug,RNA提取后测OD260/280=1.0,则CDNA浓度为
ˋ^ˊ〉-# 一般为1-2ul,但有时可能需要稀释,因为反转录系统中的某些成分可能会干扰PCR系统中的特殊定量,如环状RNA。由于产物片段问题,上述浓度可能不适用。例如,上样量150ng的miRNA通常更合适。 。
∪△∪ cDNA长度的最佳钾离子浓度是140-150mM。 3.二价阳离子二价阳离子是逆转录酶活性所必需的。 低于4mMMg2+未观察到活性;产生全长转录本的最佳浓度一般为1-100ng/ul(工作浓度)。 浓度过低和过高都会影响放大效率,但不是绝对的。 因为有的基因表达量极低,有的基因在特殊情况下表达量极高。 qPCR经常
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